Este nuevo sistema “In-System Programmer” permite programar la mayoría de los miembros de la familia AVR de ATMEL, dentro de la aplicación final o en el protoboard. Se alimenta con la fuente de la aplicación y se comunica por medio de un puerto USB al computador. Se opera con el Software “AVRSTUDIO” que viene incluido con él.
Ademas es posible programar microcontroladores en lenguaje C por medio del winavr, este es el link de descarga:
http://sourceforge.net/projects/winavr/files/